El Departamento de Química Orgánica participa activamente en tareas de extensión en coordinación con el equipo de Popularización de la Ciencia de la Secretaría de Extensión, Cultura Científica y Bienestar de la Facultad de Ciencias Exactas y Naturales a través de estaciones demostrativas experimentales y charlas de divulgación en diversos eventos, entre los que podemos mencionar la Feria del Libro, la Semana de la Química y la Noche de los Museos. Estos talleres son llevados a cabo por equipos conformados por docentes del Departamento y estudiantes de grado. El departamento cuenta con dos comisiones, una de Prensa y Difusión, y otra de Popularización de la Ciencia que se ocupan de esta área.
Por otro lado, un grupo de docentes investigadores de los Departamentos de Química Orgánica y de Química Inorgánica, Analítica y Química Física, tienen a su cargo las diversas acciones del Programa Olimpíada Argentina de Química, un programa de Extensión dirigido a estudiantes de nivel medio de todo el país, que pertenece a la Facultad de Ciencias Exactas y Naturales de la Universidad de Buenos Aires. El Programa OAQ es financiado por el Ministerio de Educación de la Nación que mantiene continuidad anual desde el año de su creación en 1991.